在你自己安装了一个新的MySQL服务器后，你需要为MySQL的root用户指定一个目录（缺省无口令），否则如果你忘记这点，你将你的MySQL处于极不安全的状态（至少在一段时间内）。
在Unix（Linux）上，在按照手册的指令安装好MySQL后，你必须运行mysql_install_db脚本建立包含授权表的mysql数据库和初始权限。在Windows上，运行分发中的Setup程序初始化数据目录和mysql数据库。假定服务器也在运行。
当你第一次在机器上安装MySQL时，mysql数据库中的授权表是这样初始化的：
你可以从本地主机（localhost）上以root连接而不指定口令。root用户拥有所有权限（包括管理权限）并可做任何事情。（顺便说明，MySQL超级用户与Unix超级用户有相同的名字，他们彼此毫无关系。）
匿名访问被授予用户可从本地连接名为test和任何名字以test_开始的数据库。匿名用户可对数据库做任何事情，但无管理权限。
从本地主机多服务器的连接是允许的，不管连接的用户使用一个localhost主机名或真实主机名。如：
% mysql -h localhost test
% mysql -h pit.snake.net test
你以root连接MySQL甚至不指定口令的事实只是意味着初始安装不安全，所以作为管理员的你首先要做的应该是设置root口令，然后根据你设置口令使用的方法，你也可以告诉服务器重载授权表是它知道这个改变。（在服务器启动时，它重载表到内存中而可能不知道你已经修改了它们。）
对MySQL 3.22和以上版本，你可以用mysqladmin设置口令：
% mysqladmin -u root password yourpassword
对于MySQL的任何版本，你可以用mysql程序并直接修改mysql数据库中的user授权表：
% mysql -u root mysql
mysql>UPDATE user SET password=PASSWORD(""yourpassword"") WHERE User=""root"";
如果你有MySQL的老版本，使用mysql和UPDATE。
在你设置完口令后，通过运行下列命令检查你是否需要告诉服务器重载授权表：
% mysqladmin -u root status
如果服务器仍然让你以root而不指定口令而连接服务器，重载授权表：
% mysqladmin -u root reload
在你设置了root的口令后（并且如果需要重载了授权表），你将需要在任何时候以root连接服务器时指定口令。