minix
最老的、认为也是最可靠的，但性能上是很有限的（有时没有标志，文件名最多 30 个字符）并且容量也是有限的（每个这样的文件系统最多 64MB）。
xia
一个 minix 文件系统的修正版本，降低了对文件名长度以及文件系统大小的限制，但并没有引进新的特性。它并不流行，但据报道工作的很好。
ext2
非常有特色的出自于 Linux 的文件系统，也是当今最流行的文件系统。它被设计成易于升级的，这样文件系统代码的新版本就不需要重建已存在的文件系统。
ext
是 ext2 的老版本，不是向上兼容的。已不再在安装中使用了，并且大多数人都已转换到了 ext2。
另外，还支持一些外来的文件系统，使得与其他操作系统交换文件变得更容易了。这些外来的文件系统工作起来如同本地的一样，只是它们缺乏一些通常的 UNIX 的特征，或者有着奇特的限制或其它古怪的地方。
msdos
与 MS-DOS 的（以及 OS/2 和 Windows NT） FAT 文件系统兼容。
usmdos
是在 Linux 下对 msdos 文件系统的扩展，支持长文件名、所有者、权限、连接以及设备文件。这使得一个常规的 msdos 文件系统能够想 Linux 的文件系统一样的使用，因此对Linux来说也就无需一个独立的分区了。
Iso9660
标准的 CD-ROM 文件系统；自动支持允许更长文件名的 Rock Ridge 扩展文件系统。它是对标准 CD-ROM 文件系统的扩展。
nfs
一个网络文件系统，允许在许多计算机之间共享一个文件系统，易于这些计算机对文件的访问。
hpfs
OS/2 的文件系统。
sysv
SystemV/386,以及 Xenix 文件系统。
要依具体情况来选择使用文件系统。如果兼容性或其它原因使得需要使用一个非原始的文件系统，那就必须使用其中的一个。如果能自由地选用文件系统的话，那么选用 ext2 也许是最明知的，因为它有所有的特征并且没有性能上的下降。
还有一种 proc 文件系统，通常作为 /proc 目录来访问，它其实完全不是一个真正的文件系统，尽管看起来它很象。proc 文件系统使得访问某些内核的数据结构变得很容易，如进程列表（因此还有名字）。它使得这些数据结构看起来很象是一个文件系统，并且能够使用所有通常的文件工具来操作处理。例如，要取得所有进程的一个列表，可以使用命令。
摘自：网易社区